Moleculaire routekaart coronavirus ontwikkeld
Wetenschappers hebben een uitgebreide moleculaire routekaart van het coronavirus gepresenteerd. In de zogeheten COVID-19 Disease Map worden alle tot nu toe bekende interacties die het virus aan gaat met menselijke cellen in kaart gebracht. In totaal gaat het om een verzameling van 1836 interacties. Deze kennis draagt bij aan het verder ontrafelen van het werkingsmechanisme van het coronavirus en de zoektocht naar behandelmethoden en een vaccin. De COVID-19 Disease Map is gemaakt door een internationale groep wetenschappers, waarbij het Maastricht UMC+ en de Universiteit Maastricht nauw bij zijn betrokken.
We komen steeds meer te weten over hoe het coronavirus (SARS-CoV-2) te werk gaat en waarom het zich gedraagt zoals het zich gedraagt. Het binnendringen van het virus in een gastheercel is een complex geheel van interacties op moleculair niveau. Die verzameling van interacties worden in wetenschappelijke termen ook wel pathways genoemd. Bij deze moleculaire processen zijn tientallen eiwitten en genen van zowel het virus als de gastheer (in dit geval de mens) betrokken.
Collectie van interacties
Om de moleculaire processen goed gevisualiseerd te krijgen wordt gebruik gemaakt van wetenschappelijke onderzoeksdata die over de hele wereld worden gegenereerd. Dagelijks komen er nieuwe wetenschappelijke publicaties over het coronavirus bij. Iedere publicatie biedt weer nieuwe kennis over een klein gedeelte van de puzzel. In de nu gepresenteerde COVID-19 Disease Map is gebruik gemaakt van 617 wetenschappelijke publicaties. Dat heeft geleid tot een collectie van 41 diagrammen, waarin 1836 moleculaire interacties worden gevisualiseerd, bestaande uit 5499 afzonderlijke elementen.
Beter begrip
De COVID-19 Disease Map is opgebouwd uit drie grote databases genaamd MINERVA (GitLab), Reactome en WikiPathways. De laatste wordt beheerd door wetenschappers van het Maastricht UMC+ en de Universiteit Maastricht. Daarmee hebben de Maastrichtse onderzoekers dan ook een substantiële bijdrage geleverd aan de totstandkoming van de gehele COVID-19 Disease Map. Bio-informaticus Martina Summer-Kutmon is dan ook met recht trots op het resultaat: "Een gestructureerd overzicht over het moleculaire werkingsmechanisme van het virus vormt de basis voor nieuw wetenschappelijk onderzoek. Daar heeft de hele wereld voordeel bij. Iedere dag dat er nieuwe kennis bijkomt, zijn we een stapje dichterbij een betere behandeling en mogelijk een vaccin."
De inhoud van de COVID-19 Disease Map is te vinden via: https://covid19map.elixir-luxembourg.org/minerva/. Op het wetenschappelijk platform wetenschappelijk platform BioRxiv publiceren de internationale groep wetenschappers hun resultaten.
Lees ook
-
Dr. Anjusha Mathew gebruikt massaspectrometrie en cryo-EM om inzicht in complexe eiwitstructuren te veranderen
De Indiase Anjusha Mathew kwam in 2018 als PhD-kandidaat naar Maastricht. Nu – 7 jaar later – is ze onderzoeker en universitair docent bij onderzoeksinstituut M4i, een onderdeel van de Faculty of Health, Medicine and Life Sciences. Onlangs ontving Mathew een groot subsidiebedrag voor haar onderzoek...
-
Esther Heuts - opleidingsdirecteur Geneeskunde
Als clinicus, onderwijskundige en moeder van drie tieners kent Esther Heuts als geen ander de voortdurend veranderende wereld van studenten en artsen. Die kennis zal Esther vanaf dit academisch jaar benutten in haar nieuwe functie als opleidingsdirecteur Geneeskunde.
-
Moleculen wegen en problemen oplossen
Michiel Vandenbosch houdt zich bezig met massaspectrometrie: op basis van gewicht bepalen welke moleculen er in een stof zitten.
