Promotie Ruben Henri Meuwese

Promotores: Dr. Steven Kelk, Prof. Dr. Ir. Ralf Peeters

Trefwoorden: Evolutie, hypothesen vergelijken, probleemgrootte verkleining, algoritmen voor onoplosbare problemen
 

"On the Origin of Agreement Forests A deep mathemathical analysis into optiminizing algorithms for kernelizing, and solving maximum agreement forest and maximum parsimony score problems in phulogenetics"


Biologen gebruiken allerlei computationele hulpmiddelen om een nauwkeurig beeld te krijgen van hoe soorten zich hebben ontwikkeld. Ruben Meuwese verbetert sommige van deze hulpmiddelen, waardoor biologen hun begrip van evolutie kunnen verdiepen. 

Deze analytische tools helpen bij het verkrijgen van inzichten in fenomenen zoals bevolkingsgroei, migratie, diergedrag en natuurlijk de evolutie van soorten. Al deze inzichten zijn gebaseerd op datasets met waarnemingen uit de echte wereld. Deze datasets zijn nooit volledig, simpelweg omdat het onmogelijk is om elk detail in de wereld waar te nemen. 

Het testen van hypotheses op deze datasets houdt in dat er verschillende modellen worden opgesteld en vergeleken die bij de dataset passen. Ruben gebruikt wiskunde om snellere algoritmen te ontwerpen voor het vergelijken van deze modellen, in dit geval voor het vergelijken van evolutionaire bomen. De versnelling wordt bereikt door de datasets te verkleinen zonder de informatie die erin zit te verliezen. 

Klik hier voor de livestream.