Promotie Deepak Balamurali

Trefwoorden: Niet-coderend RNA, Cardiovasculaire biologie, Syntenische conservatie, Single-cell omics
 

"The dark side of the Genome: A story in three-peats"

Next Generation Sequencing (NGS) heeft de genomica gerevolutioneerd door wetenschappers in staat te stellen enorme hoeveelheden DNA te sequencen en te interpreteren. Terwijl vroege onderzoeken zich voornamelijk richtten op het eiwit-coderende genoom (slechts 2% van het totale genoom), leggen recente studies de nadruk op het niet-coderende genoom, dat genen en andere biologische functies reguleert. Dit proefschrift maakt gebruik van zowel bestaande als nieuwe datasets om genexpressie te onderzoeken, met name in het hart van mensen en muizen, en vergelijkt verschillende levensfasen van de ontwikkeling van baby’s tot volwassenheid. Het gebruik van geengineerde hartweefsels (EHT's) heeft de afgelopen jaren momentum gewonnen als vervanging van diermodellen, aangezien ze meer lijken op het native menselijke weefsel dan diermodellen. In dit project hebben we voor het eerst multi-cell-type EHT's en single-nuclei sequencing gebruikt om diep in de cellen door te dringen en transcriptiewijzigingen op sub-cellulair niveau te evalueren. Deze bevindingen hebben belangrijke implicaties voor wetenschap en geneeskunde, en kunnen mogelijk bijdragen aan het begrip van ziekten en therapeutische stratificatie.

Klik hier voor de livestream.