Hoe maken planten hun eigen ‘wapens’? Slimme software zoekt antwoord.
Planten maken allerlei natuurlijke chemische stoffen die ze nodig hebben om te overleven. Als je in het algemeen weet hoe ze dat doen, dan kun je in theorie voorspellen hoe een plant om het even welke stof maakt. Nederlandse onderzoekers ontwikkelden MEANtools, software die achterhaalt hoe planten hun eigen gespecialiseerde natuurlijke stoffen aanmaken.
De chemische stoffen die planten maken, helpen hen bijvoorbeeld om ziektes te weerstaan, insecten aan te trekken of zich aan te passen aan hun omgeving. Maar hoe die stoffen precies worden gemaakt in de plant, is vaak nog onbekend.
MEANtools (Metabolite Anticipation tools) brengt daar verandering in. Het programma combineert verschillende soorten data, zoals informatie uit het DNA van een plant, welke genen actief zijn en welke stoffen er in de plant aanwezig zijn. Daarna zoekt het zelf naar verbanden en patronen, zonder dat er van tevoren iets hoeft te worden ingevuld of geraden. Dit vermindert het werk in het laboratorium, omdat wetenschappers nu heel gericht kunnen zoeken, geholpen door de voorspellingen van MEANtools.
De onderzoekers testten de tool op tomaten en ontdekten dat MEANtools bijna alle stappen wist te achterhalen van hoe tomaten falcarindiol maken, een natuurlijke stof die vermoedelijk schimmels helpt bestrijden. Nog opvallender: het programma vond ook nieuwe, nog onbekende routes die planten mogelijk gebruiken om die stof te maken.
Venlo
"Dit is een belangrijke stap vooruit in het, met moderne data, achterhalen wat er in planten gebeurt," zegt Dr. Kumar Saurabh Singh, hoofdauteur van een wetenschappelijk artikel over MEANtools. Hij werkt bij het Venlose Brightlands Future Farming Institutevan de Universiteit Maastricht. "MEANtools is niet alleen voor planten te gebruiken, maar ook voor andere organismen."
De software is open source en gratis beschikbaar, en kan waardevol zijn voor iedereen die werkt in de plantenwetenschap, geneesmiddelenonderzoek of de bredere biologie. MEANtools is een ontwikkeling van onderzoekers van de universiteiten van Maastricht, Wageningen en Utrecht.
Lees ook
-
NWO Tulp-fonds haalt toponderzoeker naar MaCSBio
MaCSBio verwelkomt toponderzoeker Irina Mohorianu in haar team. Ze komt dankzij het NWO Tulp-fonds naar Nederland. Daarnaast financiert NWO het onderzoek van Joël Karel naar elektrocardiografische beeldvorming
-
Regio Deal Noord-Limburg versnelt onderzoek naar robotica, AI en autonome teelt
Met een financiering uit de Regio Deal Noord-Limburg II zet de Universiteit Maastricht vaart achter haar ambities in Venlo. Dankzij de financiering kan de universiteit haar onderzoek naar robotica en kunstmatige intelligentie voor autonome systemen in de tuinbouw verder uitbouwen.Researchers
-
Van hartje Maastricht tot Venlo: ontdek de plekken die de Faculty of Science and Engineering bijzonder maken
Van de oorsprong van het universum tot de toekomst van ons voedsel op aarde. Bij de Faculty of Science and Engineering (FSE) werken onderzoekers en studenten aan high-tech research. Ga mee langs de verschillende locaties en ontdek het verhaal van deze bijzondere faculteit.
