Hoe maken planten hun eigen ‘wapens’? Slimme software zoekt antwoord.
Planten maken allerlei natuurlijke chemische stoffen die ze nodig hebben om te overleven. Als je in het algemeen weet hoe ze dat doen, dan kun je in theorie voorspellen hoe een plant om het even welke stof maakt. Nederlandse onderzoekers ontwikkelden MEANtools, software die achterhaalt hoe planten hun eigen gespecialiseerde natuurlijke stoffen aanmaken.
De chemische stoffen die planten maken, helpen hen bijvoorbeeld om ziektes te weerstaan, insecten aan te trekken of zich aan te passen aan hun omgeving. Maar hoe die stoffen precies worden gemaakt in de plant, is vaak nog onbekend.
MEANtools (Metabolite Anticipation tools) brengt daar verandering in. Het programma combineert verschillende soorten data, zoals informatie uit het DNA van een plant, welke genen actief zijn en welke stoffen er in de plant aanwezig zijn. Daarna zoekt het zelf naar verbanden en patronen, zonder dat er van tevoren iets hoeft te worden ingevuld of geraden. Dit vermindert het werk in het laboratorium, omdat wetenschappers nu heel gericht kunnen zoeken, geholpen door de voorspellingen van MEANtools.
De onderzoekers testten de tool op tomaten en ontdekten dat MEANtools bijna alle stappen wist te achterhalen van hoe tomaten falcarindiol maken, een natuurlijke stof die vermoedelijk schimmels helpt bestrijden. Nog opvallender: het programma vond ook nieuwe, nog onbekende routes die planten mogelijk gebruiken om die stof te maken.
Venlo
"Dit is een belangrijke stap vooruit in het, met moderne data, achterhalen wat er in planten gebeurt," zegt Dr. Kumar Saurabh Singh, hoofdauteur van een wetenschappelijk artikel over MEANtools. Hij werkt bij het Venlose Brightlands Future Farming Institutevan de Universiteit Maastricht. "MEANtools is niet alleen voor planten te gebruiken, maar ook voor andere organismen."
De software is open source en gratis beschikbaar, en kan waardevol zijn voor iedereen die werkt in de plantenwetenschap, geneesmiddelenonderzoek of de bredere biologie. MEANtools is een ontwikkeling van onderzoekers van de universiteiten van Maastricht, Wageningen en Utrecht.
Lees ook
-
De morele architecten van AI: geen halfgoden, maar ook geen code monkeys
Wie krijgt de schuld als AI de verkeerde kant opgaat? En wie is er verantwoordelijk voor het voorkomen van eventuele negatieve gevolgen? In haar proefschrift "A Showing of Hands: Making Visible the Ethical Agency of AI Developers" richt Tricia Griffin zich op de mensen achter de technologie en de...
-
Ouders betrekken bij AI: Universiteit Maastricht versterkt wetenschapswijsheid in Limburg
Hoe kun je als ouder beter begrijpen wat kunstmatige intelligentie (AI) betekent voor het onderwijs van je kind? Onder leiding van dr. Martijn Boussé start de Universiteit Maastricht een innovatief project dat ouders van middelbare scholieren in Limburg actief betrekt bij het ontwikkelen van...
-
Twee nieuwe academische opleidingen in Venlo van start
Twee opleidingen, één van de Universiteit Maastricht en één van de universiteiten in Maastricht en Nijmegen, mogen beginnen. Beide technisch-natuurwetenschappelijke opleidingen staan in het teken van een duurzame wereld en zijn onderdeel van de Faculty of Science and Engineering. De opleidingen...
